贝瑞基因(000710)丨色素失禁症三代测序综合解决方案正式上线!

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贝瑞基因三代测序复杂单基因病检测基于先进的单分子实时测序技术，致力于解决临床“检不出、检不准、检不全”难题，已覆盖CAH、SMA、FXS、地中海贫血、血友病、多囊肾、法布雷病、黏多糖贮积症Ⅱ型及动态突变panel等疾病类型。近日，三代测序色素失禁症基因检测方案正式发布，助力实现该病的精准诊断。

色素失禁症疾病介绍

色素失禁症(Incontinentia pigmenti, IP)又名 Bloch-Sulzberger综合征(OMIM #308300)，是一种X连锁显性遗传外胚层发育不良综合征，由 IKBKG 基因变异所导致。全球发病率约为(0.7~1.2)/10万，95%患者为女性，男性病情严重，多为死胎或在母亲妊娠期流产。少数存活男性IP为体细胞嵌合突变，或与Klinefelter综合征(47,XXY)有关[1]。

IP具有特征性皮肤、眼、骨骼、牙齿、指甲、中枢神经系统等多系统异常，皮疹往往是IP的首发症状和主要特征。典型皮疹可分为四期[1,2]：

图1.色素失禁症患者的皮肤四期表现

皮损均沿Blaschko线分布[2]

此外，IP患者还有皮肤外器官受累，主要表现在牙齿、眼部、中枢神经系统，极少数有乳腺、骨骼和心肺损害。其中，约50%~80%患者可出现牙齿异常;35%~77%患者有眼部损害;30%患者出现神经系统异常[1]。

色素失禁症致病基因

IKBKG 基因是已知唯一与IP相关的基因，又称为 NEMO 基因，位于X染色体(Xq28)，由10个外显子组成。在 IKBKG 基因的下游35.5kb区域存在一个序列方向相反、无功能、高度同源的假基因 IKBKGP1。IKBKG 基因与 IKBKGP1 假基因exon3上游282bp处至exon10下游相似性>99%[3]。低拷贝重复序列 LCRs(LCR1和LCR2)以及 IKBKGP1 假基因的存在，使得位于假基因上的良性变异通过基因转换或倒位等机制，转移或复制到 IKBKG 基因，从而形成新发变异[4]。

图2.IKBKG 基因结构示意图[3]

IKBKG 基因变异类型包括大片段缺失、点突变和小的插入/缺失。其中最常见的是4 – 10号外显子缺失，约占女性IP 患者病例的 80%。目前已报道的 SNVs、Indels约72个，约51%为Indels，49%为SNVs[5]。

IKBKG 基因常规检测局限性

由于受同源假基因 IKBKGP1 的干扰，传统单一的检测方法存在漏检、检测错误的问题，因此往往需要多种技术组合进行联合检测，不仅增加检测所需时间，过程也较为繁琐，给患者带来诸多不便。

贝瑞基因基于单分子实时测序(SMRT)技术的高准确度(High-Fidelity，HiFi)模式，开发出三代测序全面检测色素失禁症的方法(Comprehensive Analysis of IP，CAIP)。该技术采用多重 PCR 片段扩增的策略，检测与色素失禁症相关的 IKBKG、IKBKGP1 基因，精准检测单核苷酸变异(SNVs)、小片段插入/缺失(Indels)，基因内大片段缺失及复杂重排。

技术优势

鉴真伪

完整检测 IKBKG 以及同源假基因 IKBKGP1 的全长序列，有效排除假基因干扰

全覆盖

精准、全面检测SNVs、Indels、大片段缺失及复杂重排变异类型

高效率

克服传统方法多种检测组合、流程繁琐、费时费力的局限性

检测范围及适用人群

送检事项

检测流程

参考文献

[1] 王宪，汤建萍，李珂瑶等. 色素失禁症的诊断标准与治疗进展[J]. 中国医师杂志. 2021, 23(8): 1274-1278

[2] Bodemer C, Diociaiuti A, Hadj-Rabia S et al. Multidisciplinary consensus recommendations from a European network for the diagnosis and practical management of patients with incontinentia pigmenti. J Eur Acad Dermatol Venereol. 2020, 34(7):1415-1424.

[3] Pescatore A, Spinosa E, Casale C et al. Human Genetic Diseases Linked to the Absence of NEMO: An Obligatory Somatic Mosaic Disorder in Male. Int J Mol Sci. 2022, 21;23(3):1179.

[4] Conte MI, Pescatore A, Paciolla M et al. Insight into IKBKG/NEMO locus: report of new mutations and complex genomic rearrangements leading to incontinentia pigmenti disease. Hum Mutat. 2014,35(2):165-77.

[5] Fusco F, Pescatore A, Steffann J, et al. Clinical utility gene card: for incontinentia pigmenti. Eur J Hum Genet. 2019, 27(12):1894-1900.

*本文内容针对特定用户群，包括贝瑞基因的员工、客户、股东、医疗专业人士等。本文可能包含一些针对各种检测及诊疗方法的介绍，该类信息只作为知识提供，不应被视为诊疗指导或建议，不能取代向医生或其他医疗专业人士进行咨询，您必须向医生或其他医疗专业人士咨询。